Những công trình đầu tiên tạo tiền đề cho các chủ đề nghiên cứu lập trình di truyền và ứng dụng hiện nay rất đa dạng, bao gồm tổng hợp và sửa chữa phần mềm, mô hình dự đoán, khai thác dữ liệu,[19] mô hình tài chính,[20] cảm biến mềm,[21] thiết kế,[22] và xử lý hình ảnh.[23] Các ứng dụng trong một số lĩnh vực, chẳng hạn như thiết kế, thường sử dụng các biểu diễn trung gian,[24] chẳng hạn như mã hóa tế bào của Fred Gruau.[25] Sự tiếp nhận công nghiệp đã trở nên đáng kể trong một số lĩnh vực bao gồm tài chính, công nghiệp hóa chất, tin sinh học[26][27] và công nghiệp thép.[28]